办理超市营业执照的流程如下：
携带身份证、房产证、租房合同的复印件去当地工商部门进行名称预先核准，选定一个符合规定的店名。
去卫生监督部门为店主和员工办理健康证，以证明他们适合从事食品行业的工作。
准备好身份证、房产证、租房合同、健康证的复印件和名称核准通知书，前往工商部门申请食品流通许可证。这是根据《食品安全法》，卖食品必须办理的证件。
如果超市销售烟草制品，还需向烟草局申请烟草专卖零售许可证。
携带所有相关证件及复印件至工商部门办理营业执照。材料齐全且符合要求的情况下，一般一周时间就能拿到营业执照。
拿到营业执照后，在30天内携带营业执照正副本原件、租赁合同原件和复印件、身份证原件和复印件去地税、国税部门申请《税务登记证》。
根据实际需要决定是否去当地县区级的质量技术监督管理局办理组织机构代码证，需要的话，带上营业执照正副本原件、身份证原件和复印件，去质监局办理即可。
建议：
在办理过程中，确保所有材料的真实性和完整性，并按照规定的流程进行。
如果有任何疑问或困难，可以及时咨询当地工商部门或相关机构获取帮助。
